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Metodi computazionali per i nuovi

scenari delle scienze della vita

Gli esperimenti virtuali, in silico, coprono un stituiscono dei veri e propri esperimenti condotti l’identità, la funzione e le dinamiche evolutive.
ruolo essenziale in tutti i settori delle scienze. in silico e validati poi, in vitro ed in vivo, grazie In sostanza, sarà possibile tracciare la mappa di
Nel Dipartimento di Scienze della Vita (DSV), la alla collaborazione con esperti di fama interna- tutte le cellule che costituiscono i tessuti uma-
simulazione e la modellazione sono condotte su zionale impegnati, negli ambiti dell’oncologia, ni sani e patologici. La single-cell genomics ha
diverse scale: la scala genomica e quella atomica. dell’immunologia e delle neuroscienze, nello rappresentato per il gruppo di Bioinformatica del
studio delle basi genomiche dei sistemi biologici DSV un ulteriore stimolo allo sviluppo di meto-
Metodi computazionali per la complessi. Tali collaborazioni, rafforzate dall’a- di e strumenti ancora più potenti per la gestione,
single-cell genomics zione sinergica dei programmi di finanziamento la modellazione e l’interpretazione dell’enorme

dello European Research Council e di AIRC 5 per quantità di dati generati dalle tecniche a singo-
Il gruppo di Bioinformatica e Biologia Compu- mille, hanno condotto a rilevanti scoperte circa le la cellula. In particolare, il gruppo di ricerca è
tazionale del DSV (PI: Silvio Bicciato) si oc- basi molecolari dello sviluppo dei tumori e del-
cupa da tempo dello sviluppo e applicazione di le loro metastasi e hanno permesso di mettere a
metodi e strumenti informatici per l’analisi in- punto strumenti informatici per l’identificazione
tegrata di dei dati genomici ottenuti grazie alle di indicatori genetici della sensibilità dei tumori
tecnologie di sequenziamento massivo. Da un ai farmaci e per la scoperta di molecole capaci di
punto di vista metodologico, la ricerca ha come agire specificamente sulle cellule tumorali.
obiettivo la messa a punto di algoritmi, tecniche
e software per l’analisi integrata della struttura Recentemente, le tecnologie di sequenziamento
tridimensionale del DNA, delle sue caratteristi- massivo hanno reso possibile l’analisi dell’asset-
che epigenetiche e dei livelli di espressione dei to genetico, epigenetico e trascrizionale di ogni
geni, mentre da un punto di vista applicativo, si singola cellula presente in un tessuto (single-cell
propone di identificare i principali meccanismi di genomics). Attraverso tale potenza investigativa la
regolazione della trascrizione che caratterizzano comunità scientifica sarà, a breve, in grado di rag-
il funzionamento delle cellule in condizioni nor- giungere un obiettivo a lungo inseguito: analizzare
mali e patologiche. Le analisi computazionali co- l’eterogeneità delle cellule nei tessuti, studiarne Impronte digitali dei mutanti adRP

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